人体消化道作为体内营养物质的吸收场所，就象一个战场一样，每天都在发生大大小小的战役，各种病毒、病菌、毒素组成入侵军团，体内免疫球蛋白、乳铁蛋白、过氧化物酶、溶菌酶、有益菌等则组成防御部队。

母乳喂养婴儿其结肠双歧杆菌和乳酸杆菌（有益菌）为优势菌丛，具有较强的抵抗致病原定植的免疫能力，是因为含有大量的乳铁蛋白和免疫球蛋白。强化乳铁蛋白牛初乳喂养的婴儿近50％其粪便中双歧杆菌为优势菌丛。。

美国马里兰大学研究发现，口服牛初乳，可以预防和抑制志贺病菌和轮状病毒等引起的小儿腹泻。Hilpert等利用牛初乳中抗轮状病毒抗体来治疗婴儿急性轮状病毒性胃肠炎，有显著作用。

同时牛初乳中的乳过氧化物酶可以杀灭的微生物主要包括李斯特菌、大肠杆菌、沙门氏菌、空肠弯曲菌、金黄色葡萄球菌及其他一些有害的革兰氏阴性菌。李斯特菌为食物中毒菌，空肠弯曲菌为可致人类急性肠炎的重要致病菌，大肠杆菌和沙门氏菌也均为常见致病微生物。澳大利亚阿得雷克妇幼医疗中心也得出了这样的结论。美国旧金山医院两位教授研究证实，口服牛初乳粉还对治疗隐性孢子虫引起的腹泻有明显效果。

这些免疫因子各司其职，既能直接在肠胃形成天然的免疫屏障，在获得病菌病毒入侵信号后，能马上识别和绑定，作出包裹、杀灭等相应的处理，调整体内菌群结构，而有效降低被感染的几率。特别是免疫球蛋白有很强的特异记忆功能，能有效预防疾病反复发作。